Mangan có thể được sử dụng để làm sạch nước thải và nước ngầm.
Khi nồng độ sắt trong nước ngầm quá cao sẽ gây ra một số ảnh hưởng đến sản xuất và đời sống của chúng ta như nước đục và có mùi sắt, cặn dễ hình thành, quần áo giặt sẽ có vết rỉ sét... Mangan có thể oxy hóa sắt trong nước, oxy hóa sắt hóa trị hai hòa tan trong nước thành sắt hóa trị ba không hòa tan và kết tủa để loại bỏ. Ngoài ra, mangan còn có thể dùng để lọc asen trong nước thải.
Mangan thường được sử dụng ở dạng bột hoặc hạt. Nó có thể được thêm vào nước hoặc áp dụng thông qua bộ lọc. Lượng mangan sử dụng phụ thuộc vào nồng độ sắt, mangan trong nước và thể tích nước cần xử lý. Thông thường, 1-2 mg chất oxy hóa mangan được thêm vào mỗi gallon. Chi phí mangan tương đối thấp. Nó cũng là một chất xử lý nước tương đối an toàn, không gây hại cho cơ thể con người. Đó là kinh tế và thân thiện với môi trường để sử dụng.
Nhiều nhà sản xuất xử lý nước và Bên Kỹ thuật bổ sung các hợp chất mangan dưới đây vào quy trình xử lý nước của họ.