Mangan chủ yếu được sử dụng làm chất khử trùng, chất oxy hóa dược phẩm, chất xúc tác, v.v. trong lĩnh vực y tế.
Ví dụ, thuốc tím là một trong những chất khử trùng được sử dụng phổ biến nhất trong y học vì nó là chất oxy hóa rất mạnh. Dung dịch thuốc tím nồng độ 0,1%+ có thể đóng vai trò khử trùng và khử trùng. Ngoài vai trò là chất oxy hóa trung gian trong quá trình sản xuất thuốc an thần Fenal, mangan còn được dùng làm chất xúc tác để sản xuất ra thuốc giảm đau hạ sốt phenacetin.
Mangan cũng có thể được sử dụng trong lĩnh vực y tế để điều chế một số loại thuốc và công thức thuốc, chẳng hạn như một số loại thuốc điều trị tình trạng thiếu mangan. Ngoài ra, mangan còn có thể đóng vai trò xúc tác trong ngành chiết xuất thực vật.
Rất nhiều công ty dược phẩm bổ sung ít hóa chất mangan vào quy trình sản xuất của họ: